2013年度市县科学发展综合考核评价对象为全省11个设区市和100个县(市、区)，考核评价内容包括党的建设、社会建设、经济发展及成效、民生工程、生态环境等5个一级指标，总权重为300分，其中经济发展及成效权重为120分，占考核总权重的40%，党的建设权重为60分，社会建设权重为50分，民生工程权重为40分，生态环境权重为30分。为充分反映当年发展实绩，各考核评价指标总量和增幅权重基本按3:7的比例设置。
为使考核评价更加公平公正，新的综合考核评价体系将对11个设区市和100个县(市、区)予以差别化分类考核评价。设区市按年末总人口分为两类，2012年末总人口300万人以上的为一类、300万人以下为二类。根据《江西省主体功能区规划》，将县（市、区）按功能区规划分为三类，重点开发区35个县为一类，农业主产区33个县为二类，重点生态区32个县为三类。按照县(市、区)主体功能区规划分类情况，设置三类权重，在工业、农业、服务业和生态环境指标上进行区分，各类县(市、区)分别单独计分。
市县科学发展综合考核评价体系的建立，受到基层普遍欢迎。宜丰县是省级生态县之一，该县县委书记邓伟认为，新的考核评价体系具有三个显著特点：一是将发展成效与发展质量、经济总量与发展速度结合起来考核评价；二是尊重和区分各设区市、县(市、区）在发展基础、发展条件和主体功能区规划上的差异；三是既注重在过去基础上的进步与发展，又注重同等条件下发生的实际变化。“这一考核评价体系的实施，可从制度上对‘唯GDP论英雄’发展观进行修正，将有效引导全省市县加速转型发展。”
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